Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931417E11RikQ9CR05 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms