Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms