Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab5aQ9CQD1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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