Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9CQC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9CQC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQC3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9CQC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9CQC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9CQC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms