Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkp2Q9CQ73 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms