Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cntnap2Q9CPW0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap2Q9CPW0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap2Q9CPW0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms