Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim26Q99PN3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms