Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2a1Q99PM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms