Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.7 ms