Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NsmfQ99NF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NsmfQ99NF2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms