Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll1Q99NC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms