Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a6cQ99N08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms