Protein–RNA interactions for Protein: Q99LP6

Grpel1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel1Q99LP6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grpel1Q99LP6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grpel1Q99LP6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms