Protein–RNA interactions for Protein: Q99L90

Mcrs1, Microspherule protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrs1Q99L90 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcrs1Q99L90 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcrs1Q99L90 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcrs1Q99L90 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms