Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nmd3Q99L48 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmd3Q99L48 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms