Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q99KU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q99KU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q99KU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q99KU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q99KU6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q99KU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q99KU6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q99KU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q99KU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q99KU6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q99KU6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q99KU6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q99KU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q99KU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q99KU6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q99KU6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q99KU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q99KU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q99KU6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q99KU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q99KU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q99KU6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q99KU6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms