Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PpifQ99KR7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms