Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcf19Q99KJ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf19Q99KJ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf19Q99KJ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms