Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd6Q99JI4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd6Q99JI4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms