Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Smim11aQ99J19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smim11aQ99J19 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim11aQ99J19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim11aQ99J19 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim11aQ99J19 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smim11aQ99J19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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