Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atad3Q925I1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atad3Q925I1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atad3Q925I1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms