Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csmd1Q923L3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csmd1Q923L3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms