Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp4Q921I6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Sh3bp4Q921I6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp4Q921I6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp4Q921I6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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