Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pde6cQ91ZQ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pde6cQ91ZQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Pde6cQ91ZQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde6cQ91ZQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Pde6cQ91ZQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Pde6cQ91ZQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Pde6cQ91ZQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Pde6cQ91ZQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Pde6cQ91ZQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde6cQ91ZQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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