Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc5a4bQ91ZP4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4bQ91ZP4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms