Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd248Q91V98 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd248Q91V98 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd248Q91V98 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd248Q91V98 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms