Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc2Q8VBV3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms