Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc58Q8R3Q6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc58Q8R3Q6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms