Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc12Q8R344 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms