Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sumf1Q8R0F3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sumf1Q8R0F3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sumf1Q8R0F3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms