Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufs8Q8K3J1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs8Q8K3J1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms