Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stn1Q8K2X3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stn1Q8K2X3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stn1Q8K2X3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms