Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo18Q8K2I9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo18Q8K2I9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo18Q8K2I9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms