Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Depp1Q8K2F3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Depp1Q8K2F3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms