Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcho1Q8K285 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcho1Q8K285 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms