Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd3Q8K1Y2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkd3Q8K1Y2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prkd3Q8K1Y2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms