Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek9Q8K1R7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek9Q8K1R7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek9Q8K1R7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms