Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc4a8Q8JZR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a8Q8JZR6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms