Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL2

Mchr1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mchr1Q8JZL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mchr1Q8JZL2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mchr1Q8JZL2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms