Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q4Q8HWB2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q4Q8HWB2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q4Q8HWB2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms