Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwnkQ8CIW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwnkQ8CIW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms