Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Parp11Q8CFF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp11Q8CFF0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms