Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ4

Amer2, APC membrane recruitment protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer2Q8CCJ4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Amer2Q8CCJ4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Amer2Q8CCJ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms