Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RybpQ8CCI5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RybpQ8CCI5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms