Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi27Q8C6G0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi27Q8C6G0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms