Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmo3Q8BZL8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmo3Q8BZL8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmo3Q8BZL8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms