Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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Usp47Q8BY87 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp47Q8BY87 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
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Usp47Q8BY87 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp47Q8BY87 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp47Q8BY87 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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