Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrfn5Q8BXA0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrfn5Q8BXA0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms