Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx17Q8BVL3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx17Q8BVL3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx17Q8BVL3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms