Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scfd2Q8BTY8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scfd2Q8BTY8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scfd2Q8BTY8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms